影响色谱峰展宽的因素有很多种，但不外乎柱内和柱外两类。柱内因素是指色谱柱本身的性能，如柱活性大小、固定相是否与样品发生化学反应、柱效是否足够高、样品是否超载等；柱外因素主要是指接头的死体积、进样口和检测器死体积等。
进样口造成的峰展宽的原因有两种：一是时间上的展宽，二是空间上的展宽。根据速率理论，谱峰展宽的因素包括涡流扩散、分子扩散、气相传质阻力、流动相的流速等。
1.涡流扩散是指在填充色谱柱中，流动相通过填充物的不规则空隙时，其流动方向不断地改变，因而形成紊乱的类似“涡流”的流动。由于填充物的大小、形状各异以及填充的不均匀性，使得组分各个分子在色谱柱中经过的通道直径和长度不等，从而造成他们在柱中的停留时间不同，其结果就是使得色谱峰变宽。
2.分子扩散是指在试样进入色谱柱后，在色谱柱轴向上造成浓度梯度，使得组分分子产生浓差扩散，主要与组分在气相中的扩散系数大小有关。
3.气相传质阻力与填充物粒度、组分在载气流中的扩散系数有关，主要是试样在两相界面上不能瞬间达到分配平衡，有的分子还来不及进入两相界面就被气相带走，有的分子在进入两相界面后还来不及返回气相，这就造成了色谱峰展宽。
4.固定相传质阻力同气相传质阻力类似，与固定液膜厚度、组分在液相中的扩散系数有关，不过它是发生在气液界面和固定相之间的，也会引起色谱峰的扩张。
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